高凤翰自幼聪慧，早年师从张在辛学习书画篆刻，后游历各地，结交文人雅士。康熙五十六年（1717年）中秀才，雍正五年（1727年）被荐举为安徽歙县县丞，后任绩溪县令。乾隆二年（1737年）因两淮盐运使卢见曾案牵连入狱，右臂瘫痪，后以左手作书画，风格更为独特。
高凤翰的绘画以山水、花卉为主，笔墨苍劲老辣，构图新颖，尤擅画梅花。他的书法以隶书和行草见长，左手书法别具一格。篆刻方面，他取法秦汉，刀法浑厚，风格古朴。其诗作清新自然，著有《南阜山人诗集》《砚史》等。
高凤翰晚年寓居扬州，与郑板桥、金农等人交游，成为“扬州八怪”中的重要人物。他的艺术成就对后世影响深远，尤其在左手书画领域独树一帜。