王先谦学术成就斐然，尤其在经学、史学和文献整理方面贡献突出。他主持编纂或校勘了大量经典文献，如《汉书补注》《后汉书集解》《荀子集解》《庄子集解》等，被誉为“清代考据学集大成者”。其著作《汉书补注》是研究《汉书》的重要参考书，至今仍被学界广泛引用。
在政治立场上，王先谦保守稳健，反对维新变法，但与张之洞等洋务派人物关系密切。晚年致力于教育事业，推动湖南近代教育改革，对湖湘文化的发展影响深远。
王先谦的学术风格严谨扎实，注重考据与义理结合，其著述以资料翔实、注释精审著称，为后世学者提供了宝贵的文献基础。